TAF的药物相互作用主要受体内转运蛋白和肾脏排泄机制影响。临床严禁或慎用的药物主要包括强效P-gp诱导剂（如利福平、卡马西平）及具有肾毒性的药物。
降低TAF疗效的药物（P-gp/BCRP诱导剂）

TAF是P-糖蛋白（P-gp）和乳腺癌耐药蛋白（BCRP）的底物。若合用能够激发这些蛋白活性的药物，会降低TAF在血浆中的浓度，从而导致抗病毒疗效下降甚至失效。
抗惊厥药物：如卡马西平、奥卡西平、苯妥英、苯巴比妥等。
抗结核药物：如利福平、利福布丁、利福喷丁。
草药产品：如圣约翰草（贯叶连翘）。

增加不良反应风险的药物
TAF主要通过肾脏的肾小球滤过和经肾小管主动分泌排泄。若与影响肾功能的药物合用，可能导致药物浓度蓄积，增加毒性风险。
抗病毒药物：如阿昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦、缬更昔洛韦、西多福韦、福司考韦等。
抗生素：氨基糖苷类抗生素（如庆大霉素）。
解热镇痛药：高剂量或多个非甾体类抗炎药（NSAIDs）。

禁止联用的特定药物
为防止TAF血浆浓度异常升高，禁止其与麦角衍生物、西沙必利、匹莫齐特、阿夫唑嗪、西地那非、胺碘酮或奎尼丁等同时服用。

无显著相互作用的药物
在临床上，炔雌醇、伊曲康唑、酮康唑、索非布韦、咪达唑仑、炔诺酮、舍曲林等药物与TAF合用时，未发现显著的相互影响。
TAF的用药配伍较为复杂。在服用TAF期间，若因其他疾病需要新增任何处方药、非处方药或中草药，必须提前告知肝病科医生，由医生评估是否存在药物冲突。